LKJ主機采用符合IEC國際標準的6U x 160標準機箱、插件結構。6U標準插件采用二個符合IEC標準的對外信號連接器，96芯連接器完成VME標準總線信號連接，48芯連接器完成輸入/輸出信號連接，在滿足VME信號標準的同時，提高了板內的電磁兼容性。標準的模塊化結構，可實現功能的擴充與升級。主機箱的選型及設計除在強度、重量、安裝及電磁兼容等方面進行綜合考慮外、還重點考慮了機箱的外觀設計。裝置在防止非法拔插電路板方面及記錄數據人工防護方面也采取了有效的措施（在機箱正面加裝帶鎖的玻璃門）。